陈磊 教授,博士生导师

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个人简介 

陈磊博士的主要研究方向为肠道稳态调控的新机制。博士期间主要研究肠道菌群对肿瘤发生与治疗的影响,建立了肠道菌群与药物作用机制的研究平台,并于2014年在香港浸会大学获得博士学位。2015年底,赴美国Rutgers University从事博士后研究,将研究领域拓展至肠道宿主细胞的调控,从而实现了自身研究背景中的药物-肠道菌群-宿主细胞调控的领域连接。国家级人才获得者,于2022年受聘为LDSports乐动体育教授,并入选LDSports乐动体育青年首席教授。

代表研究工作包括建立了BMP信号通路调控肠道细胞分化的新机制,发现了决定肠吸收细胞系命运的关键因子;揭示了肠道干细胞更新中的重要代谢调控新机制;发现了影响肠道发育的关键转录因子调控网络等。以第一作者或通讯作者在Nature GeneticsGastroenterologyNature Communications等国际著名学术期刊上发表文章15篇;并以共同作者在Genes & DevelopmentPNASCancer Research等发表文章10篇;因发现转录因子HNF4与抑癌基因在肠道的前馈调控获得Gallo Award for Outstanding Cancer Research。陈磊博士有着丰富的项目主持与参与经验,主持了美国新泽西州癌症研究委员会资助项目,参与了美国国立卫生研究院R01科研项目3项、香港研究资助局项目1项、澳门科学技术发展基金委研究项目1项以及江苏省高校自然科学研究重大项目、江苏省自然科学基金等3项。

 

研究方向 

        小肠是人体最主要的消化吸收器官,而肠上皮细胞又是成人体内更新最快的一类细胞。肠道干细胞分化为具有增殖功能的肠上皮隐窝细胞,隐窝细胞向绒毛不断迁移,并进一步分化为小肠绒毛细胞。肠道干细胞是肠道损伤再生、肠癌等多种肠道疾病研究的焦点。课题组旨在建立类器官 (临床科研一体化)、药物-肠菌-宿主细胞 (新药研发产业化) 和表观遗传学 (前沿基础科学研究) 的科研平台,结合生物信息学、小鼠遗传学、表观遗传学、代谢组学、类器官体外培养和宏基因组学等,探索肠道稳态调控的新机制,发现肠紊乱疾病治疗的新靶点。

 

近期代表性论文

[1] Chen L., Toke N.H., Luo S., Vasoya R.P., Fullem R.L., Parthasarathy A., Perekatt A.O., Verzi M.P., A reinforcing HNF4-SMAD4 feed-forward module stabilizes enterocyte identity. Nature Genetics, 2019, 51(5):777-785 

[2] Chen L., Vasoya R.P., Toke N.H., Parthasarathy A., Luo S., Chiles E., Flores J., Gao N., Bonder E.M., Su X.Y., Verzi M.P., HNF4 regulates fatty acid oxidation and is required for renewal of intestinal stem cells in mice. Gastroenterology, 2020, 158(4):985-999

 [3] Chen L.*, Luo S., Dupre A., Vasoya R.P., Parthasarathy A., Aita R., Malhotra R., Hur J., Toke N.H., Chiles E., Yang M., Cao W., Flores J., Ellison C.E., Gao N., Sahota A., Su X.Y., Bonder E.M., Verzi M.P.*, The nuclear receptor HNF4 drives a brush border gene program conserved across murine intestine, kidney, and embryonic yolk sac. Nature Communications, 2021, 12(1):2886 (*通讯作者)

 [4] Chen L., Cao W., Aita R., Aldea D., Flores J., Gao N., Bonder E.M., Ellison C.E., Verzi M.P., Three-dimensional interactions between enhancers and promoters during intestinal differentiation depend upon HNF4. Cell Reports, 2021, 34(4):108679

 [5] Chen L.*, Marishta A., Ellison C.E., Verzi M.P.*, Identification of Transcription Factors Regulating SARS-CoV-2 Entry Genes in the Intestine. Cellular and Molecular Gastroenterology and Hepatology, 2021; 11(1): 181-184 (*通讯作者)

 [6] Wang Y.*, Chen L.*, Lung tissue distribution of drugs as a key factor for COVID-19 treatment. British Journal of Pharmacology, 2020, 177(21):4995-4996 (*通讯作者)

 [7] Chen L., Toke N.H., Luo S., Vasoya R.P., Aita R., Parthasarathy A., Tsai Y.H., Spence J.R., Verzi M.P., HNF4 factors control chromatin accessibility and are redundantly required for maturation of the fetal intestine. Development, 2019, 146(19). pii: dev179432 (封面文章)

 [8] Kumar N1, Tsai Y.H.1, Chen L.1, Zhou A.B., Banerjee K.J., Saxena M., Huang S., Toke N.H., Xing J.C., Shivdasani R.A., Spence J.R., Verzi M.P., The lineage-specific transcription factor CDX2 navigates dynamic chromatin to control distinct stages of intestine development. Development, 2019, 1;146(5). pii: dev172189 (1共同第一作者)

 [9] Yang Y., Gomez M., Marsh T., Poillet-Perez L., Sawant A., Chen L., Park N.R., Jackson S.R., Hu Z., Alon N., Liu C., Debnath J., Guan J.L., Davidson S., Verzi M., White E. Autophagy in PDGFRα+ mesenchymal cells is essential for intestinal stem cell survival. Proc Natl Acad Sci U S A, 202224;119(21):e2202016119

 [10] Banerjee K.K., Saxena M., Kumar N., Chen L., Cavazza A., Toke N.H., O'Neill N.K., Madha S., Jadhav U., Verzi M.P., Shivdasani R.A., Enhancer, transcriptional, and cell fate plasticity precedes intestinal determination during endoderm development. Genes & Development, 2018, 32(21-22):1430-42

 [11] Perekatt A.O., Shah P.P., Cheung S., Jariwala N., Wu A., Gandhi V., Kumar N., Feng Q., Patel N., Chen L., Joshi S., Zhou A., Taketo MM.., Xing J., White E., Gao N., Gatza M.L., Verzi M.P., SMAD4 suppresses WNT-driven de-differentiation and oncogenesis in the differentiated gut epithelium. Cancer Research, 2018, 78(17):4878-90

  

完整发表文章列表https://orcid.org/0000-0001-7812-508X